Программы, обслуживающие файл PDB

Конвертирование файла PDB

После установки одного из приложений из списка программ, которые Вы нашли здесь, у Вас не должно быть никаких проблем с открытием или редактированием файла с расширением PDB. Если у Вас все же остается проблема с этим, Вы можете конвертировать файлы PDB в другой формат.

Конвертирование файла с расширением PDB в другой формат

Конвертирование файлов другого формата в файл PDB

Мы надеемся, что помогли Вам решить проблему с файлом PDB. Если Вы не знаете, где можно скачать приложение из нашего списка, нажмите на ссылку (это название программы) - Вы найдете более подробную информацию относительно места, откуда загрузить безопасную установочную версию необходимого приложения.

Что еще может вызвать проблемы?

Поводов того, что Вы не можете открыть файл PDB может быть больше (не только отсутствие соответствующего приложения).
Во-первых - файл PDB может быть неправильно связан (несовместим) с установленным приложением для его обслуживания. В таком случае Вам необходимо самостоятельно изменить эту связь. С этой целью нажмите правую кнопку мышки на файле PDB, который Вы хотите редактировать, нажмите опцию "Открыть с помощью" а затем выберите из списка программу, которую Вы установили. После такого действия, проблемы с открытием файла PDB должны полностью исчезнуть.
Во вторых - файл, который Вы хотите открыть может быть просто поврежден. В таком случае лучше всего будет найти новую его версию, или скачать его повторно с того же источника (возможно по какому-то поводу в предыдущей сессии скачивание файла PDB не закончилось и он не может быть правильно открыт).

Вы хотите помочь?

Если у Вас есть дополнительная информация о расширение файла PDB мы будем признательны, если Вы поделитесь ею с пользователями нашего сайта. Воспользуйтесь формуляром, находящимся и отправьте нам свою информацию о файле PDB.

You"re here because you have a file that has a file extension ending in .pdb. Files with the file extension .pdb can only be launched by certain applications. It"s possible that .pdb files are data files rather than documents or media, which means they"re not meant to be viewed at all.

what is a .pdb file?

A variety of applications are associated with the .pdb file extension. It is used as a program database file type that many applications use such as MS Visual Studio, Pegasus, etc. However, in this format, .pdb files usually cannot be opened by just any application other than the application installed with it. This file extension is also used as a Palm Desktop Database File wherein it is also used by Palm-based PDA devices. These files contain variety of information. They can be spreadsheets, databases, images, etc. .pdb files are also files in the Protein Data Bank File format; a format used when studying structures of protein which is why these files are mostly used by the Research Collaboratory for Structural Bioinformatics. The .pdb file extension is also used as PowerDesigner Database Backup File used by PowerDesigner database wherein these .pdb files refer to data that this database saves as well as they also contain other file references.

how to open a .pdb file?

Launch a .pdb file, or any other file on your PC, by double-clicking it. If your file associations are set up correctly, the application that"s meant to open your .pdb file will open it. It"s possible you may need to download or purchase the correct application. It"s also possible that you have the correct application on your PC, but .pdb files aren"t yet associated with it. In this case, when you try to open a .pdb file, you can tell Windows which application is the correct one for that file. From then on, opening a .pdb file will open the correct application.

applications that open a .pdb file

Microsoft Visual Studio

Microsoft Visual Studio

Palm Desktop

a word of warning

Be careful not to rename the extension on .pdb files, or any other files. This will not change the file type. Only special conversion software can change a file from one file type to another.

Название (англ.): Palm Desktop Database File

Название (рус.): Файл базы данных Palm Desktop

Разработчик: Palm

Описание: PDB также известный как Palm Desktop Database File представляет собой формат файла базы данных используемый в операционной системе Palm OS. Разработчиком данного формата является Palm – американская компания, специализирующаяся на производстве программного обеспечения для ОС Palm, а также смартфонов и карманных компьютеров. Файлы этого типа используются для хранения различных данных. Их внутреннее содержимое может быть представлено графикой, текстом, картами, базами данных и т.п. Форматом поддерживается форматирование текста, а также использование стилей шрифтов. В Windows файлы PDB могут быть открыты с помощью XnView, Calibre и некоторых других программах.

Формат 2

Название (англ.): Program Database File

Название (рус.): Файл базы данных

Разработчик: Нет данных

Описание: PDB или Program Database File представляет собой формат файла базы данных. Файлы этого типа могут быть используемы различным программным обеспечением, к примеру, такими приложениями как MS Visual Studio, Intuit Quicken. Содержащаяся в них информация хранятся в строго структурированном виде. Как правило, файлы PDB сохраняются в собственном формате. При этом конкретный PDB-файл может быть открыт только той программой, которая его создала. Например, PDB-файл, созданный с помощью Microsoft Visual Studio нельзя будет открыть в Palm Pilot.

Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:

Формат 3

Название (англ.): Protein Data Bank File

Название (рус.): Данные молекул белков и нуклеиновых кислот

Разработчик: wwPDB

Описание: PDB также известный как Protein Data Bank File представляет собой специальный формат файла данных. Файлы этого типа можно встретить в программах, предназначенных для хранения результатов исследований в сфере биологии и биохимии. Разработчиком данного формата является wwPDB. Внутреннее содержимое PDB-файлов представлено трехмерными координатами, описывающими атомную структуру белкового или другого химического соединения. В настоящее время формат PDB является стандартным форматом хранения данных, полученных в результате изучения белковых соединений. Просмотреть файлы PDB можно с помощью специальных программ QuteMol, RasMol или Avogadro.

Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:

Формат 4

Название (англ.): PowerDesigner Database Backup File

Название (рус.): Резервная копия базы данных PowerDesigner

Разработчик: Sybase

Описание: PDB иначе PowerDesigner Database Backup File представляет собой собственный формат файла резервной копии используемой в PowerDesigner – профессиональном программном инструменте для создания моделей данных и разработки архитектуры предприятий. Разработчиком формата является Sybase – американская компания, специализирующаяся на производстве программного обеспечения для управления базами данных. Внутреннее содержимое файла PDB обычно представлено информацией из базы данных, а также ссылками на другие файлы. Предназначаются PDB-файлы для создания резервной копии основной базы данных. Открыть их можно с помощью «родной» программы PowerDesigner.

Для открытия (редактирования) файла этого формата можно использовать следующие программы:

У вас есть проблема с открытием.PDB-файлов? Мы собираем информацию о файловых форматах и можем рассказать для чего нужны файлы PDB. Дополнительно мы рекомендуем программы, которые больше всего подходят для открытия или конвертирования таких файлов.

Для чего нужен файловый формат.PDB?

Главная ассоциация расширения .pdb принадлежит формату файлов "База данных Palm OS" и связанному с ним типу файлов PDB. Palm OS — это одна из ранних операционных систем, специально разработанных для мобильных устройств. В Palm OS не используется файловая система, а все данные хранятся в памяти в виде базы данных.

Расширение .pdb обычно присваивается как файлам с данными, так и приложениям, принятым с устройства Palm OS в процессе синхронизации. Файл .pdb фактически представляет собой контейнер, который может содержать любой тип данных. Это может быть документ, файл с данными, отдельная база данных или приложение. Различные типы БД Palm OS имеют различные внутренние форматы, на что указывает специальный код формата в заголовке файла. В виде PDB-файлов часто встречаются электронные книги (главным образом MOBI).

"Родная" поддержка файлов PDB обеспечивается только устройствами Palm OS. На компьютере такие файлы необходимо открывать при помощи просмотрщика. Существует множество просмотрщиков, а также сетевых и автономных конвертеров в формат/из формата PDB.

В ином значении расширение .pdb также применяется для обозначения типа формата файлов "Банк данных белков" (Protein Data Bank, PDB). Protein Data Bank — это международный реестр всех известных видов белков, а PDB представляет собой стандартный текстовый формат описания составы и структуры белковых молекул в трехмерном представлении.

Формат PDB повсеместно принят в качестве стандартного формата передаваемых в Protein Data Bank и получаемых оттуда данных. PDB-файлы можно открыть, обрабатывать и изображать графически при помощи целого ряда приложений молекулярного анализа, моделирования и визуализации на всех основных платформах.

Применительно к приложениям для MS Windows, разработанным при помощи MS Visual Studio, расширение .pdb обозначает формат файлов "Символы отладки" (Debugging Symbols, PDB) и ассоциированный с ним тип файлов. Файл PDB является базой данных символов отладки, генерируемых из исходного кода приложения в процессе компиляции. Для запуска и работы приложения PDB-файлы не требуются — они, как правило, остаются у разработчика и используются в целях отладки.

Наконец, расширение .pdb использует SAP/Sybase PowerDesigner — комплексное расширяемое решение по моделированию на уровне предприятия — для обозначения файлов резервных копий своих моделей физических данных (Physical Data Model, PDM). Файл .pdb является резервной копией файла модели .pdm .

Программы для открытия или конвертации PDB файлов

Формат PDB может быть нескольких основных модификаций:

• - расширение PDB (полн. Palm Desktop Database File ) представляет собой файл базы данных, ассоциирующийся с платформой Palm OS. ОС Palm - ранняя операционная система, функционирующая на базе различных мобильных устройств. Принципиальная ее особенность - это фактическое отсутствие файловой системы, поэтому хранение и обработка данных производится непосредственно в памяти в рамках СУБД.

Данный формат может быть присвоен как файлам, содержащим набор структурированных данных, так и обычным программным приложениям, которые прошли процесс синхронизации на базе ОС Palm. По своей сути, расширение PDB - репозиторий, которое может содержать практически любой тип данных: текстовый документ, исполнительную программу, файл базы данных и.т.д. Отличить тип внутреннего формата файла ОС Palm позволяет уникальный заголовок в виде специального кода. В качестве PDB формата могут выступать даже электронные справочники (чаще всего MOBI).

Форматирование PDB расширения поддерживается только на базе “родной” ОС Palm, однако воспроизвести его на платформе другой операционной системы можно с использованием некоторых браузеров, самыми популярными среди которых являются XnView и Palm Desktop . Допускается и сетевая загрузка PDB файла посредством специализированных Интернет-ресурсов.

• формат PDB (полн. Protein Data Bank ) может выступать в качестве “Базы данных протеинов и белков”. Protein Data Bank - всемирно признанный реестр данных всевозможных типов белков и протеинов. Трехмерные координаты атомов, химический состав, структура компонентов молекул белка - это лишь самый незначительный перечень ключевых параметров, которые может включать в себя стандартный PDB файл.

Основное практическое назначение данного формата - это хранение и обмен данными между пользователем и международным реестром Protein Data Bank .

PDB файлы доступны для визуализации, форматирования и графического наполнения с использованием целого ряда специализированных программных комплексов молекулярного анализа, например, Avogadro или Richardson Lab KiNG .

• PDB файлы также могут относится к категории файлов Program Database (файлы базы данных). Особенностью формата PDB является уникальная структура данных, которая распознается только “родным” для него приложением. Например, PDB файл, скомпилированный посредством плагина Pegasus , будет не доступен в Microsoft Visual Studio .
• расширение PDB (полн. PowerDesigner Database Backup File ) представляет собой файл резервной копии базы данных, сгенерированной в PowerDesigner . Основное практическое назначение PDB файла - это восстановление поврежденной или утраченной БД.

Программы для открытия PDB файлов

В зависимости от своего практического назначения и конкретной модификации, PDB расширение может быть сгенерировано и открыто для редактирования с использованием следующих программных комплексов:

Для случаев, когда PDB файл представляет собой файл базы данных, ассоциирующийся с платформой Palm OS, можно воспользоваться следующими программными утилитами:

• в ОС Windows используются DC & Co iSilo , Fictionwise eReader , LLUSoft PDB Explorer , XnView и Palm Desktop ;
• на базе ОС Mac PDB будет доступен с применением программных плагинов Fictionwise eReader , PorDiBle , txt2pdbdoc , XnView , Planamesa NeoOffice и Lemkesoft GraphicConverter .

Примечательно, что расширение адаптировано и для использования на платформе Linux c помощью программных приложений txt2pdbdoc и XnView .

Когда PDB файл применяется в качестве “Базы данных протеинов и белков”, могут быть использованы следующие утилиты:

• в ОС Windows - Richardson Lab KiNG , RasMol , Jmol и Avogadro ;
• на базе ОС Mac PDB формат будет доступен с применением программных плагинов Apple Safari with JmolApplet or Protein Workshop applet и Avogadro .

Следует отметить, что расширение может использоваться и на платформе Linux c помощью целого комплекса программных приложений, включая Mozilla Firefox with JmolApplet or Protein Workshop applet , Richardson Lab KiNG , RasMol , Jmol и Avogadro .

Если PDB формат относится к категории файлов Program Database (файлы базы данных), то для редактирования файла в ОС Windows можно использовать программы Intuit Quicken , Microsoft Visual Studio 2010 и Mint.com .

Редактирование PDB файлов поддерживается и на базе ОС Mac с помощью Mint.com и Intuit Quicken Essentials for Mac .

Для случаев, когда PDB расширение ассоциируется с категорией файлов резервной копии базы данных, воспроизвести файл на платформе ОС Windows можно с помощью программного комплекса Sybase PowerDesigner .

Если при открытии расширения PDB возникает ошибка, причины могут заключаться в следующем:

• поврежден или инфицирован файл;
• файл не связан с реестром ОС (выбрано некорректное приложение для воспроизведения или не произведена инсталляция конкретного плагина);
• недостаточно ресурсов устройства или ОС;
• поврежденные или устаревшие драйвера.

Конвертация PDB в другие форматы

Несмотря на то, что PDB расширение имеет большое число самых разнообразных исполнений и модификаций, его конвертация в другие форматы поддерживается только в ряде случаев, в частности, когда PDB файл представляет собой файл базы данных, ассоциирующийся с платформой Palm OS.

Почему именно PDB и в чем его достоинства?

Приходится констатировать, что PDB-расширение не является столь популярным и востребованным форматом среди обычных пользователей. Однако формат может быть востребован в нескольких узкоспециализированных областях.Он широко используется в качестве:

• файла базы данных, ассоциирующийся с платформой Palm OS ;
• “Базы данных протеинов и белков ”, где установлены трехмерные координаты атомов, химический состав, структура компонентов молекул белка;
• файлов Program Database (файлы базы данных);
• резервной копии базы данных.